“草到安国方成药，药经祁州始生香”，祁州（今安国）千百年来便被冠以“千年药都”和“天下第一药市”的美誉。
故事发生在明末清初，刘家乃祁州最大的药商，刘老爷为祁州北大会的会长，在祁州药商界有很高的名望。随着祁州药市规模的不断壮大，同为祁州大药商的赵家开始对刘家充满了嫉恨。
刘文元，刘家独子，安客堂的堂主，为人刚正不阿，自小受高人指点，一边学医，一边跟在父亲身边学习医药经营。偶然的机会与京城来的戏班名角白玉竹相识，两人的相爱遭到了赵家二公子赵天麻的仇恨。为了横刀夺爱，也为了让刘家在祁州的生意衰落，从而把刘文元推下安客堂堂主的位置，赵家使出种种手段陷害刘家，于是一场明争暗斗的官商之争及爱情故事在千年药都由此展开。